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有了這些數(shù)據(jù)庫,就算自己沒有臨床數(shù)據(jù),也能發(fā)論文!

發(fā)布時間:2025-08-08 來源:石榴學術(shù) 瀏覽量: 字號:【加大】【減小】 手機上觀看

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國外常用的醫(yī)學類數(shù)據(jù)庫

1. 臨床與電子健康記錄(EHR)數(shù)據(jù)庫

  • MIMIC-III/IV

    • MIT推出的重癥監(jiān)護病房(ICU)患者數(shù)據(jù)庫,包含生命體征、實驗室檢查、用藥記錄等(需申請訪問)。

    • 官網(wǎng):https://mimic.mit.edu/

  • eICU Collaborative Research Database

    • Philips與MIT合作的多中心ICU數(shù)據(jù)庫,覆蓋美國多家醫(yī)院數(shù)據(jù)。

  • UK Biobank

    • 英國50萬人的健康數(shù)據(jù),包括臨床記錄、基因組、影像等(需申請)。

    • 官網(wǎng):https://www.ukbiobank.ac.uk/

  • All of Us Research Program

    • 美國NIH主導的百萬級人群健康數(shù)據(jù)庫,涵蓋多樣化人群。

    • 官網(wǎng):https://allofus.nih.gov/

2. 基因組與生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫

  • NCBI GeneBank & dbGaP

    • 美國國家生物技術(shù)信息中心(NCBI)的基因序列數(shù)據(jù)庫和基因型-表型數(shù)據(jù)庫(需申請)。

    • 官網(wǎng):https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

  • TCGA (The Cancer Genome Atlas)

    • 癌癥基因組數(shù)據(jù),涵蓋33種癌癥的分子特征和臨床數(shù)據(jù)。

    • 官網(wǎng):https://www.cancer.gov/tcga

  • GTEx (Genotype-Tissue Expression)

    • 正常人體組織的基因表達與調(diào)控數(shù)據(jù)。

    • 官網(wǎng):https://gtexportal.org/

  • ClinVar

    • 疾病相關(guān)基因變異的臨床解讀數(shù)據(jù)庫。

3. 醫(yī)學影像數(shù)據(jù)庫

  • The Cancer Imaging Archive (TCIA)

    • 癌癥影像數(shù)據(jù)集(CT/MRI/PET等),與TCGA配套。

    • 官網(wǎng):https://www.cancerimagingarchive.net/

  • CheXpert

    • 斯坦福大學的胸部X光數(shù)據(jù)集,用于肺炎等疾病檢測。

  • OASIS

    • 阿爾茨海默病研究的腦部MRI數(shù)據(jù)集。

    • 官網(wǎng):https://www.oasis-brains.org/

4. 藥物與化合物數(shù)據(jù)庫

  • PubChem

    • 化學化合物、藥物活性及分子結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫。

    • 官網(wǎng):https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/

  • DrugBank

    • 藥物靶點、作用機制和藥代動力學數(shù)據(jù)。

    • 官網(wǎng):https://go.drugbank.com/

  • ChEMBL

    • 歐洲分子生物學實驗室(EMBL)的藥物活性數(shù)據(jù)。

5. 流行病學與公共衛(wèi)生數(shù)據(jù)庫

  • WHO Global Health Observatory

    • 世界衛(wèi)生組織的全球疾病負擔、疫苗接種等數(shù)據(jù)。

    • 官網(wǎng):https://www.who.int/data/gho

  • CDC WONDER

    • 美國疾控中心的死亡、傳染病、環(huán)境健康數(shù)據(jù)。

    • 官網(wǎng):https://wonder.cdc.gov/

  • Our World in Data

    • 全球健康、疾病和疫苗接種的可視化數(shù)據(jù)。

6. 其他特色數(shù)據(jù)庫

  • SEER (Surveillance, Epidemiology, and End Results)

    • 美國國家癌癥研究所的癌癥發(fā)病率和生存率統(tǒng)計。

  • FAIRsharing

    • 生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫的標準化目錄(可檢索領(lǐng)域特定數(shù)據(jù)庫)。

注意事項

  • 數(shù)據(jù)權(quán)限:部分數(shù)據(jù)庫(如UK Biobank)需申請并通過倫理審查。

  • 數(shù)據(jù)格式:注意數(shù)據(jù)類型(如DICOM、FASTQ、CSV)及配套元數(shù)據(jù)。

  • 工具支持:許多數(shù)據(jù)庫提供API或?qū)S霉ぞ撸ㄈ鏣CIA的NBIA工具)。

根據(jù)研究需求選擇合適的數(shù)據(jù)庫時,建議查閱相關(guān)論文或平臺文檔以確認數(shù)據(jù)的覆蓋范圍和訪問流程。



國內(nèi)常用的醫(yī)學類數(shù)據(jù)庫

1. 臨床與健康大數(shù)據(jù)平臺

  • 國家健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)中心(中國多個區(qū)域中心)

    • 上海申康醫(yī)聯(lián)中心:覆蓋上海市38家三甲醫(yī)院臨床數(shù)據(jù)。

    • 北京大學健康醫(yī)療大數(shù)據(jù)國家研究院:提供多中心臨床研究數(shù)據(jù)支持。

    • 由國家衛(wèi)健委主導,分布在 北京、上海、江蘇、福建、山東 等地,整合了區(qū)域性醫(yī)院的電子病歷(EHR)、影像、檢驗等數(shù)據(jù)(需申請權(quán)限)。

    • 示例:

  • 中國醫(yī)院質(zhì)量監(jiān)測系統(tǒng)(HQMS

    • 國家衛(wèi)健委醫(yī)院管理研究所主導,涵蓋全國三級醫(yī)院的病案首頁數(shù)據(jù)(需申請)。

  • 中國卒中中心聯(lián)盟(CSCA)數(shù)據(jù)庫

    • 全國卒中患者的臨床診療數(shù)據(jù),用于腦血管病研究。

2. 基因組與生物醫(yī)學數(shù)據(jù)庫

  • 中國國家基因庫(CNGB, 深圳)

    • 全球領(lǐng)先的綜合性基因數(shù)據(jù)庫,存儲中國人群基因組數(shù)據(jù)(需申請)。

    • 官網(wǎng):https://www.cngb.org/

  • 中國人類遺傳資源共享平臺(GSA-Human)

    • 由科技部支持,提供基因組、表觀組等數(shù)據(jù)(需審批)。

    • 官網(wǎng):https://ngdc.cncb.ac.cn/gsa-human/

  • 國家生物信息中心(CNCB)/ 國家基因組科學數(shù)據(jù)中心(NGDC)

    • 整合多個子數(shù)據(jù)庫(如GVM、GSA),涵蓋微生物、癌癥、新冠等數(shù)據(jù)。

    • 官網(wǎng):https://ngdc.cncb.ac.cn/

3. 中醫(yī)藥數(shù)據(jù)庫

  • 中醫(yī)藥大數(shù)據(jù)中心(國家中醫(yī)藥管理局)

    • 整合中醫(yī)診療方案、方劑、針灸等數(shù)據(jù)。

  • TCMID (Traditional Chinese Medicine Integrated Database)

    • 中藥成分、靶點及疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫。

    • 訪問:http://www.megabionet.org/tcmid/

  • TCMSP (中醫(yī)藥系統(tǒng)藥理學數(shù)據(jù)庫)

    • 中藥活性成分、ADME參數(shù)及靶點預(yù)測工具。

    • 官網(wǎng):https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php

4. 疾病與流行病學數(shù)據(jù)庫

  • 中國疾病預(yù)防控制中心(CDC)公共衛(wèi)生科學數(shù)據(jù)中心

    • 傳染病報告、慢性病監(jiān)測、營養(yǎng)健康等數(shù)據(jù)(部分公開)。

    • 官網(wǎng):http://www.phsciencedata.cn/

  • 中國癌癥登記中心(NCCR)

    • 發(fā)布《中國腫瘤登記年報》,提供地區(qū)性癌癥發(fā)病率數(shù)據(jù)。

  • 中國心血管病登記(China PEACE)

    • 全國性心血管病診療和預(yù)后研究數(shù)據(jù)庫。

5. 醫(yī)學影像數(shù)據(jù)庫

  • 中國醫(yī)學影像AI數(shù)據(jù)庫(如LUNA16)

    • 肺部CT影像數(shù)據(jù)集,用于肺結(jié)節(jié)檢測算法開發(fā)。

  • EyePACS (中國糖尿病視網(wǎng)膜病變數(shù)據(jù)集)

    • 眼底圖像數(shù)據(jù),與國際項目合作。

6. 其他特色資源

  • 國家人口健康科學數(shù)據(jù)中心(NPHC)

    • 整合臨床、基礎(chǔ)醫(yī)學、公共衛(wèi)生等多領(lǐng)域數(shù)據(jù)(需注冊)。

    • 官網(wǎng):https://www.ncmi.cn/

  • 萬方醫(yī)學網(wǎng) / 中國知網(wǎng)(CNKI)醫(yī)學庫

    • 中文醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫,含臨床指南、病例報告等。

注意事項

  • 數(shù)據(jù)權(quán)限:國內(nèi)醫(yī)學數(shù)據(jù)通常需通過倫理審查和行政審批(如《人類遺傳資源管理條例》)。

  • 語言:部分數(shù)據(jù)庫僅提供中文界面。

  • 區(qū)域覆蓋:不同數(shù)據(jù)庫的地域代表性差異較大(如城鄉(xiāng)差異)。

如果需要使用這些數(shù)據(jù)庫,建議通過官方渠道聯(lián)系相關(guān)機構(gòu),并關(guān)注 國家科技資源共享服務(wù)平臺(https://www.escience.org.cn/)的最新動態(tài)。


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